Сравнительная характеристика файловых систем FAT32 и NTFS
.Логическое объединение секторов в кластеры позволяет уменьшить размер таблицы FAT и ускорить доступ к файлу.
...с тысячами документов, или, тем более, на файл- серверах - преимущества структуры NTFS смогут дать реальный выигрыш быстродействия...